Pracą Powiatowego Centrum Pomocy Rodzinie we Wrześni kieruje Dyrektor na zasadzie jednoosobowego kierownictwa. Od dnia 7 listopada 2023 roku dyrektorem PCPR we Wrześni jest Olga Krukowska (powołana Uchwałą nr 1830/2023 Zarządu Powiatu Wrzesińskiego z dnia 26 września 2023 roku w sprawie przeniesienia Pani Olgi Krukowskiej - Dyrektora Domu Pomocy Społecznej we Wrześni na stanowisko Dyrektora Powiatowego Centrum Pomocy Rodzinie we Wrześni).
Dyrektor PCPR sprawuje bezpośredni nadzór nad komórkami organizacyjnymi PCPR.
Do obowiązków Dyrektora, zgodnie z §13 ust. 1 Regulaminu Organizacyjnego PCPR we Wrześni należą:
1. zapewnienie sprawnego funkcjonowania Centrum,
2. sprawowanie nadzoru nad organizacją pracy i realizacją zadań Centrum,
3. koordynowanie działalności komórek organizacyjnych Centrum,
4. wykonywanie uprawnień pracodawcy wobec pracowników,
5. reprezentowanie Centrum wobec organów administracji, instytucji i osób trzecich,
6. racjonalne gospodarowanie funduszami i składnikami majątku pozostającymi w dyspozycji Centrum,
7. nadzorowanie spraw związanych z planowaniem i realizacją budżetu Centrum oraz gospodarowanie mieniem Centrum,
8. prowadzenie postępowań i wydawanie decyzji administracyjnych z zakresu administracji publicznej, w ramach posiadanego upoważnienia,
9. realizacja polityki kadrowej, w tym ustalanie liczby etatów w komórkach organizacyjnych oraz zakresu wykonywanych obowiązków na stanowiskach pracy,
10. zatwierdzanie planów finansowych wynikających z zadań statutowych realizowanych przez Centrum,
11. składanie Radzie całorocznego sprawozdania z działalności PCPR oraz przedstawianie wykazu potrzeb z zakresu pomocy społecznej,
12. przyjmowanie, rozpatrywanie skarg i wniosków,
13. wydawanie aktów wewnętrznych w formie zarządzeń, regulaminów, instrukcji oraz innych o podobnym charakterze,
14. wykonywanie innych zadań zastrzeżonych dla Dyrektora przez przepisy prawa, uchwały Rady i Zarządu.